Școlile din Republica Moldova vor trece în subordinea Ministerului Educației și Cercetării, odată cu înființarea Agențiilor Teritoriale pentru Educație (ATE). Măsura este prevăzută de reforma „Restart în educație”, aprobată de Guvern. În prezent, școlile sunt administrate de consiliile raionale și municipale, prin intermediul direcțiilor locale de învățământ. Grădinițele și instituțiile extrașcolare vor rămâne în administrarea autorităților publice locale. Odată cu transferul către Agențiile Teritoriale pentru Educație, școlile vor fi finanțate direct din bugetul de stat, în baza costului standard per elev. În prezent, banii ajung la instituții prin intermediul bugetelor locale. Bugetele școlilor și rapoartele privind executarea lor vor fi publicate online, astfel încât părinții și comunitățile să poată vedea cum sunt cheltuiți banii publici. Directorii Agențiilor Teritoriale pentru Educație vor fi selectați prin concurs și numiți pentru mandate de cinci ani și nu vor putea deține mai mult de două mandate. Funcționarii actualelor direcții raionale și municipale de învățământ vor putea fi transferați în posturile vacante din cadrul noilor agenții. Guvernul urmează să înființeze, până la 30 octombrie 2026, cele 35 de ATE-uri, structura și efectivul-limită al acestora. Transferul școlilor și aplicarea noului sistem de finanțare sunt prevăzute pentru 1 ianuarie 2027. Școlile din regiune nu sunt vizate de reformă, în baza legii speciale privind autonomia UTA Găgăuzia.
